Rakenduse osas võib selle lihtsalt jagada kahte kategooriasse, nimelt tööstuslikud endoskoobid ja meditsiinilised endoskoobid.
Seoses tööstuslike endoskoopide tüüpidega jagunevad need kujutise vormis optilisteks endoskoobideks, fiiberoptilisteks endoskoobideks, elektroonilisteks endoskoobideks, CCD-videoendoskoobideks, CMOS-videoendoskoobideks ja elektrilisteks 360-kraadiseteks endoskoobideks. Endoskoobi valgusallika tüübi järgi jaguneb see kõrgsageduslikuks-luminofoorlambi endoskoobiks, fiiberoptiliseks halogeenlambi endoskoobiks ja LED-endoskoobiks.
Mis puutub meditsiiniliste endoskoopide klassifikatsiooni, siis vastavalt nende arengule ja pildistruktuurile võib need jämedalt jagada kolme kategooriasse: jäigad toru endoskoobid, optilise kiu (toru tüüpi) endoskoobid ja elektroonilised endoskoobid.
Arstlikuks läbivaatuseks mõeldud endoskoope on palju erinevaid ja nende klassifitseerimismeetodid on erinevad. Üldiselt on järgmised kolm klassifitseerimismeetodit levinumad. Turumüügi osas jagunevad enimkasutatud kategooriad praegu kahte tüüpi: jäigad peeglid ja painduvad peeglid.
